多くのタンパク質には、⾮常によく似た構造を持つ異なるサブタイプが存在することがありますが、わずかな構造の違いが活性や機能に⼤きな変化をもたらす場合があります。カリクレインタンパク質はセリンプロテアーゼであり、異なる構造を持つタンパク質サブタイプの好例です。カリクレインタンパク質の構造を明らかにすることは、ヒトのタンパク質がどのように保存され、どのように互いに異なっているかを理解するのに役⽴ちます。
本研究では、マイクロ流体変調分光法(MMS) を⽤いて、3種類のカリクレインタンパク質：KLK-1、KLK-3、KLK-7 の⼆次構造組成を正確に決定しました。これらのKLKは、末端の切断部位と転写後の修飾部位の両⽅が異なっています。ヒトカリクレインタンパク質は通常、N 末端付近の切断を介して活性化されますが、この実験では、プロ酵素とも呼ばれる不活性型(すなわち全⻑配列)の構造を解析しました。さらに、この実験から得られたMMS の結果を、α-キモトリプシンのプロ酵素であり、KLK タンパク質と同様の⽅法でN 末端付近の切断を介して活性化されるキモトリプシノーゲンから得られたMMS データと⽐較しました。
本研究の⽬的は、この情報を⽤いて、結果を結晶構造と⽐較し、配列の類似性と差異がタンパク質のサブタイプの全体的な構造と機能においてどのような役割を果たしているかの仮説を⽴てることです。
このApplication NoteをPDFでダウンロードいただけます。ご希望の場合は下記にご入力をお願いします。